舢舨洲灯塔所在的舢舨洲位于南沙最尖角———龙穴岛东侧的一个小岛，四面临水，舢舨洲虽然只有20余米高，其位置之险可谓“龙穴之口，虎门之喉”。 舢舨洲西侧是华南最大修造船基地所在地龙穴岛，龙穴造船基地目前可建造30万吨级超大型油轮(VLCC)、大型集装箱船、大型矿砂船(VLOC)；东侧是华南地区最大的火力发电基地沙角电厂。
舢舨洲南接伶仃洋、北望狮子洋，原本开阔的伶仃洋面在进入川鼻水道后大幅变窄，舢舨洲灯塔正处于广州港主航道伶仃航道与川鼻水道的交接点，此处有多处险滩、暗礁，也因此被称为“龙穴之口，虎门之喉”，夜间过往船舶，都需由舢舨洲灯塔指引，方能安全通航。目前每天在舢舨洲周围水域往来船舶约为4000艘次左右，是我国三大通航密集区之一。此外，位于灯塔周围的沙角锚地群，也是进出广州港船舶重要的侯泊、生产基地。